次世代シーケンス解析(NGS)を依頼するなら、どのようなシーケンサーを完備し、どんな解析をしてくれるのか、サービス内容をしっかり確認しておきたいものです。ここでは、次世代シーケンス受託解析をサービス提供するファーマフーズ アプロサイエンスについて詳しくご紹介します。どの会社へ依頼しようか迷われている方は、ぜひ参考にしてください。
アプロサイエンスは、1990年に先端の科学技術を活かした受託分析企業として誕生。研究者の専門的なパートナーとして歴史を重ね、2022年にファーマフーズの一部事業となりました。背景に長年培われたノウハウがあるため、解析技術に関しても安定した品質が期待できそうです。
ファーマフーズ アプロサイエンスのモットーは「ユーザー第一」。研究内容や研究者が目指す結果などをふまえ、要望に合わせた適切な提案を心がけています。科学は信頼を基盤として成り立っているとの考えから、実験計画や実施、結果報告に関しても誠実さを忘れません。
次世代シーケンス解析については、イルミナ社やPacBio社といった世界的なシェアを誇るメーカーのシーケンサーを使い分けることで、様々な用途に沿った解析に対応。遺伝子発現解析やゲノム解析、メタゲノム解析など、多様なサンプルや目的を相談できます。
ファーマフーズ アプロサイエンスのモットーは「研究の流れを止めない!」。細胞内のタンパク質の機能や構造を網羅的に把握するプロテオーム解析を中心とした受託サービスを提供しており、ゲノム解析と併用すればより精度の高い結果を得ることが可能です。
次世代シーケンス解析については、エクソーム解析やゲノム変異解析、メチル化解析、メタゲノム解析、RNA-Seq、ChIPシーケンスなど多岐に渡るメニューに対応。特にがん遺伝子やがん抑制遺伝子をターゲットとして設計された領域に対して行われる「キャンサーパネルシーケンス解析」を依頼できるのがポイントです。
次世代シーケンス解析と併用されることも多い遺伝子発現解析も、マイクロアレイやmiRNAマイクロアレイ、リアルタイムPCRと幅広い選択肢を用意しています。
プロテオーム解析は前述の通り細胞内のタンパク質の機能や構造を網羅的に調査するもので、ヒト血清・血漿を用いた解析やリン酸化ペプチドを濃縮・精製したのち解析を行うもの、部位特異的なタンパク質を網羅的に同定するFFPE組織からのショットガン解析など、様々な調査内容に対応しています。
メタボロームとは「代謝物」を指し、この解析は主に医療分野においてがん細胞特有の代謝を理解するためや、腸内細菌叢の代謝分析、農作物やアルコール飲料の生産工場分析などに用いられます。その他、脂質を解析するリピドーム解析や、ニオイを計測する香気解析といったメニューもあります。
このメディアでは、研究要件に合わせて次世代シーケンス受託解析する会社を紹介しています。研究内容に合った解析サービスをお探しの方は、ぜひ参考にしてください。
上記はいずれもイルミナ社のシーケンサーで、NovaSeq6000はすべてのゲノム、およびシーケンス方法や規模に対応。HiSeqシリーズも汎用性が高く、柔軟性やスピードにも富んだ次世代シーケンス解析を可能としています。特にHiSeq®2500は大規模シーケンスを想定したパワーがポイントで、サンプル解析からデータ統合まで一貫したワークフローを提供してくれる機器です。
こちらはPacBio社が提供するシーケンサーで、ロングリードシーケリングに適しているのが特徴。1分子リアルタイム(SMRT®)シークエンシングテクノロジーを基盤としていることから、高精度かつ長いリード取得が可能なのです。
公式HP記載なし
会社名 | 株式会社ファーマフーズ アプロサイエンスグループ |
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所在地 | 徳島県徳島市南末広町4-53 エコービル4F |
営業時間 | 公式HP記載なし |
営業日 | 公式HP記載なし |
電話番号 | 088-678-6372 |
公式サイトURL | https://apro-s.com/ |
「実験相談窓口」を設け、様々な生物種や解析目的に応じた実験計画から実験プロトコル、データ解析まで研究者の立場に立った提案をしてくれる。
遺伝子解析の中でも、ThruPLEX技術を用いたタカラバイオオリジナル解析サービス「cfDNA変異解析」を提供。変異した遺伝子を検出。
遺伝子バイオマーカーの測定から、コンパニオン診断薬(CDx)を含む体外診断用医薬品の開発、薬事申請、製造販売までワンストップで対応。
【選定条件】
※2023年2月20日調査時点で「次世代シーケンス解析 受託」とGoogle検索し、50位までに表示されるNGS受託サービスを提供する企業29社のうち、「ISO9001」を取得し、他社の受託解析を代理店販売しておらず、公式HPでサービス内容をしっかり確認できる日本資本の会社を3社ピックアップ。その中から公式サイトで確認できる情報をもとに以下の条件で要件ごとに各サービスを選定。
初めての受託解析…北海道システム・サイエンス(調査した結果、3社のうち唯一、実験相談窓口※サービスを行っている)
※参照元:北海道システム・サイエンス公式HP(https://hssnet.co.jp/product/total-support/)
cfDNA変異解析…タカラバイオ(調査した結果、3社のうち唯一、オリジナルcfDNA変異解析※を提供している)
※参照元:タカラバイオ公式HP(https://catalog.takara-bio.co.jp/jutaku/basic_info.php?unitid=U100009437)
新薬の開発…理研ジェネシス(調査した結果、3社のうち唯一、開発・薬事申請・製造販売までワンストップで対応※できる)
※参照元:理研ジェネシス公式HP(https://www.rikengenesis.jp/placement/development.html)