北海道システム・サイエンス

引用元：北海道システム・サイエンス公式HP（https://hssnet.co.jp/）

次世代シーケンス解析（NGS）を依頼するなら、どのようなシーケンサーを完備し、どんな解析をしてくれるのか、サービス内容をしっかり確認しておきたいものです。ここでは、次世代シーケンス受託解析をサービス提供する北海道システム・サイエンスについて詳しくご紹介します。どの会社へ依頼しようか迷われている方は、ぜひ参考にしてください。

北海道システム・サイエンスはどんな企業なのか

対応するサービスとは

北海道システム・サイエンスの次世代シーケンス解析は、データ前処理からディープシーケンスの応用まで、解析以外にも幅広いサービスを展開しているのが特徴。Illumima社のシーケンサーは4機種、PacBio社のシーケンサーは新しいものを1機種揃えており、解析に応じて適切に使い分けられています。

ゲノミクス

形質や疾患に関連する遺伝子変異情報の取得や、微生物のゲノム配列の決定、目的遺伝子の探索などを目的として行われる、ゲノミクスを対象とした次世代シーケンス解析。特に微生物関連での需要が高いようで、ロングリードとショートリード、2種類の解析法から目的に合わせて選べます。

トランスクリプトミクス

発現変動遺伝子の探索や融合遺伝子の検出、転写物の配列データベースを得る目的などで行われるのがこちらのトランスクリプトミクス。データベースの無い生物種に関する発現変動遺伝子の探索にも対応しており、Small RNAや新規RNAの解析も可能です。

メタゲノミクス・メタトランスクリプトミクス

腸内細菌叢や環境細菌叢といった微生物叢の探索・比較、および機能遺伝子レベルでの微生物叢の比較などを目的とする次世代シーケンス解析。微生物群集解析だけでなくショットガンメタゲノム解析などにも対応しているようです。詳しくは北海道システム・サイエンスへお問い合わせください。

その他、ゲノム編集やディープシーケンス応用、状況によってはFFPE検体の遺伝子解析も相談可能。ディープシーケンス応用はIlluminaとPacBio双方のアンプリコンシーケンスに対応しています。

このメディアでは、研究要件に合わせて次世代シーケンス受託解析する会社を紹介しています。研究内容に合った解析サービスをお探しの方は、ぜひ参考にしてください。

シーケンサーの種類

NovaSeq／HiSeqX／MiSeq

北海道システム・サイエンスでは、用途に応じてイルミナ社では3種類のシーケンサーを用意。NovaSeqシリーズは研究ニーズに沿ったフレキシブルなパフォーマンスが特徴で、優れた操作性と迅速かつコストもふまえた結果取得が可能です。HiSeqXは全ゲノム解析専用の大規模シーケンサーとなっており、1台で年間1800人分のデータを取得※できます。また、MiSeqはロングリードに特化したコンパクトなシーケンサーで、卓上で使用できるのも特徴と言えるでしょう。

PacBio Sequel II

こちらはPacBio社が開発したロングリードシーケンシング向きのシーケンサーで、1分子リアルタイム（SMRT®）シークエンシングテクノロジーを基盤としていることから、高精度かつ長いリードを得ることができます。

受託解析サービスの流れ

1. 公式サイトへのID登録
2. 注文（WEBフォーム／メール）
   DNA／RNA合成は入力、ファイルアップロード、注文履歴から選択の3パターン用意
3. 価格・予定納期確認ののち送信
4. 注文の確認（メールにて送付）

北海道システム・サイエンスの企業情報