次世代シーケンス解析(NGS)を依頼するなら、どのようなシーケンサーを完備し、どんな解析をしてくれるのか、サービス内容をしっかり確認しておきたいものです。ここでは、次世代シーケンス受託解析をサービス提供する生物技研について詳しくご紹介します。どの会社へ依頼しようか迷われている方は、ぜひ参考にしてください。
生物技研は次世代シーケンス解析をはじめ、遺伝子解析サービスを専門的に取り扱っているのが特徴。シーケンスだけでなくDNAの抽出から任せられるほか、結果はできる限り分かりやすい形で伝えてもらえるので、初めて検討する方にとっても心強いでしょう。
前述したDNA抽出からバイオインフォマティクスまで、すべて生物技研に所属するスタッフが対応。バクテリアや真菌の専門スタッフが揃っており、シーケンスのみなど限られたサービスのみの依頼にも柔軟に応えてくれます。
解析はすべてクリーンに整えられたDNA解析専用ラボで行い、汚染対策もしっかり。MiSeqやDNBSeq-G400、PacBio Sequelといった複数のシーケンサーを使い分けることで、サンプルを用いた次世代シーケンス解析が可能です。
生物技研の次世代シーケンス解析は、イルミナ社やMGI社など複数の特徴を持つシーケンサーを使い分けることで、様々なニーズに対応。ヒトゲノムのみならず水や土壌、糞便などをサンプルとした解析の経験も豊富です。
アンプリコンシーケンス解析では、水や糞便、土壌など様々なサンプルの解析経験あり。ショートリードの場合はillumina社のMiSeqを用いて相乗りにて解析され、ロングリードの場合はPacBio Sequelが用いられます。DNA抽出やデータ解析もオプションとして用意されているため、必要に応じてご検討ください。
PacBio Sequel lleを使用し、美しく長いロングリード(HiFiリード)を取得可能。ショートリードを用いる従来の方法に比べてギャップが生まれにくいゲノム解析を目指す場合にも有効とされています。
ヒトゲノムに関しては、全ゲノムとエキソーム解析の両方に対応。ライブラリー調製からシーケンシングまでがセットになっており、オプションでデータ解析などを追加することも可能です。
遺伝子発現解析とも呼ばれるRNA-Seq解析。1サンプルあたり40,000円(税不明)と良心的な価格で利用でき、オプションによってはRNAの抽出から任せられます。
その他、同社では生物の体液や鱗、糞便に由来する「環境DNA解析」を細かい部分まで対応。メタトランスクリプトーム解析やIso-Seq解析、生物種の同定、マーカー開発支援サービスなど幅広いサービスを行っているため、まずは一度ご相談ください。
このメディアでは、研究要件に合わせて次世代シーケンス受託解析する会社を紹介しています。研究内容に合った解析サービスをお探しの方は、ぜひ参考にしてください。
イルミナ社のシーケンサーであるMiSeqは、卓上型のコンパクトなサイズ感とロングリードに適した機能が特徴。全ゲノム解析を行う場合は微生物などに向いているのに対し、HiSeqはヒトなどの高等真核生物を対象とした全ゲノム解析が可能です。また、Nextera XTはDNAやRNA解析の際のライブラリー調製に役立つ機器として紹介されています。
PacBio Sequel llは高精度で長いリードを得るため、1分子リアルタイム(SMRT®)シークエンシングテクノロジーが基盤となっているシーケンサー。DNBSEQ-G400はMGI社が提供する機器で、中規模以上のゲノム解析向けのコアプラットフォームとされています。
会社名 | 株式会社生物技研 |
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所在地 | 神奈川県相模原市緑区長竹657 |
営業時間 | 公式HP記載なし |
営業日 | 公式HP記載なし |
電話番号 | 042-780-8333 |
公式サイトURL | https://gikenbio.com/ |
「実験相談窓口」を設け、様々な生物種や解析目的に応じた実験計画から実験プロトコル、データ解析まで研究者の立場に立った提案をしてくれる。
遺伝子解析の中でも、ThruPLEX技術を用いたタカラバイオオリジナル解析サービス「cfDNA変異解析」を提供。変異した遺伝子を検出。
遺伝子バイオマーカーの測定から、コンパニオン診断薬(CDx)を含む体外診断用医薬品の開発、薬事申請、製造販売までワンストップで対応。
【選定条件】
※2023年2月20日調査時点で「次世代シーケンス解析 受託」とGoogle検索し、50位までに表示されるNGS受託サービスを提供する企業29社のうち、「ISO9001」を取得し、他社の受託解析を代理店販売しておらず、公式HPでサービス内容をしっかり確認できる日本資本の会社を3社ピックアップ。その中から公式サイトで確認できる情報をもとに以下の条件で要件ごとに各サービスを選定。
初めての受託解析…北海道システム・サイエンス(調査した結果、3社のうち唯一、実験相談窓口※サービスを行っている)
※参照元:北海道システム・サイエンス公式HP(https://hssnet.co.jp/product/total-support/)
cfDNA変異解析…タカラバイオ(調査した結果、3社のうち唯一、オリジナルcfDNA変異解析※を提供している)
※参照元:タカラバイオ公式HP(https://catalog.takara-bio.co.jp/jutaku/basic_info.php?unitid=U100009437)
新薬の開発…理研ジェネシス(調査した結果、3社のうち唯一、開発・薬事申請・製造販売までワンストップで対応※できる)
※参照元:理研ジェネシス公式HP(https://www.rikengenesis.jp/placement/development.html)