次世代シーケンス解析(NGS)を依頼するなら、どのようなシーケンサーを完備し、どんな解析をしてくれるのか、サービス内容をしっかり確認しておきたいものです。ここでは、次世代シーケンス受託解析をサービス提供するダイアジェノードについて詳しくご紹介します。どの会社へ依頼しようか迷われている方は、ぜひ参考にしてください。
ダイアジェノードはグローバル医療機器メーカーとして知られるホロジック社の傘下として、主にエピジェネティクスに関する研究や生物学的サンプル前処理、診断アッセイのためのソリューションを提供する企業。母体の技術力や機器なども活かしながら、幅広いニーズに寄り添った解析サービスを提供しています。
次世代シーケンス解析については、試薬・専用機器の品質管理を徹底することで、高い再現性を追求。結果に関してもプレゼン品質で図やデータを作成しているため、専門的な知識が薄い方にとっても分かりやすいのが魅力です。
次世代シーケンス解析は研究目的や対象によって適した方法が異なってきますが、ダイアジェノードでは顧客とのコミュニケーションを通じ、それぞれに応じたプロジェクトデザインをカスタマイズ。各プロジェクトに社内の専門家が配置されているので、一貫して手厚いフォローが受けられるでしょう。
ダイアジェノードでは、主に「エピジェネティクス解析」に着目した次世代シーケンス解析を提供。メチル化に関するメニューも豊富で、分かりやすいデータ解析と独自のワークフローによる安定した品質を心がけています。
ゲノムワイドにおけるタンパク質-DNA相互作用のマッピング研究に有用とされるChIP-seq。特異的抗体で免疫沈降したクロマチンDNAを、目的のタンパク質と照らし合わせ網羅的にシーケンシングすることで、DNAとタンパク質がお互いにどのような相互作用を持っているか明らかにできます。
500個から50000個程度の細胞があれば、特定の状態で活動可能になっている細胞の全遺伝子領域をマップできるというATAC-seq。同社では独自のプロトコルを構築し、顧客それぞれのラボでこの解析を実施できる「ATAC-seq Kit」の提供を行っています。
次世代シーケンサーを用い、遺伝子の発現量を図るRNA-seq。ダイアジェノードでは高い専門性を活かし、透明性の高い解析を追求しています。結果は包括的にまとめられた出版品質の図表で返ってくるので、確認の際分かりやすいのも魅力です。
ゲノム上の既知・特定のエリア内において、DNAのメチル化を定量解析できるサービス。解析したい対象や範囲に応じてシーケンス方法を柔軟に選べるのが特徴です。
こちらはカスタム受託サービスに該当し、ヒト、およびマウスのサンプルを用いたメチル化解析が行われます。一塩基分解能でヒトゲノム上では850,000以上、マウスゲノム上では285,000以上のCpG部位をカバー※することが可能で、データ解析まで包括的に対応してくれるほか、短納期なので高い費用対効果が期待できます。
その他、同社ではエピジェネティクス解析をメインとして、DNAのメチル化等について細やかなサービスを提供しています。
このメディアでは、研究要件に合わせて次世代シーケンス受託解析する会社を紹介しています。研究内容に合った解析サービスをお探しの方は、ぜひ参考にしてください。
公式HP記載なし
会社名 | 株式会社ダイアジェノード |
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所在地 | 富山県富山市荒川1-1-25 |
営業時間 | 公式HP記載なし |
営業日 | 公式HP記載なし |
電話番号 | 076-482-3110 |
公式サイトURL | https://diagenode.co.jp/ |
「実験相談窓口」を設け、様々な生物種や解析目的に応じた実験計画から実験プロトコル、データ解析まで研究者の立場に立った提案をしてくれる。
遺伝子解析の中でも、ThruPLEX技術を用いたタカラバイオオリジナル解析サービス「cfDNA変異解析」を提供。変異した遺伝子を検出。
遺伝子バイオマーカーの測定から、コンパニオン診断薬(CDx)を含む体外診断用医薬品の開発、薬事申請、製造販売までワンストップで対応。
【選定条件】
※2023年2月20日調査時点で「次世代シーケンス解析 受託」とGoogle検索し、50位までに表示されるNGS受託サービスを提供する企業29社のうち、「ISO9001」を取得し、他社の受託解析を代理店販売しておらず、公式HPでサービス内容をしっかり確認できる日本資本の会社を3社ピックアップ。その中から公式サイトで確認できる情報をもとに以下の条件で要件ごとに各サービスを選定。
初めての受託解析…北海道システム・サイエンス(調査した結果、3社のうち唯一、実験相談窓口※サービスを行っている)
※参照元:北海道システム・サイエンス公式HP(https://hssnet.co.jp/product/total-support/)
cfDNA変異解析…タカラバイオ(調査した結果、3社のうち唯一、オリジナルcfDNA変異解析※を提供している)
※参照元:タカラバイオ公式HP(https://catalog.takara-bio.co.jp/jutaku/basic_info.php?unitid=U100009437)
新薬の開発…理研ジェネシス(調査した結果、3社のうち唯一、開発・薬事申請・製造販売までワンストップで対応※できる)
※参照元:理研ジェネシス公式HP(https://www.rikengenesis.jp/placement/development.html)