次世代シーケンス解析(NGS)を依頼するなら、どのようなシーケンサーを完備し、どんな解析をしてくれるのか、サービス内容をしっかり確認しておきたいものです。ここでは、次世代シーケンス受託解析をサービス提供するかずさゲノムテクノロジーズについて詳しくご紹介します。どの会社へ依頼しようか迷われている方は、ぜひ参考にしてください。
2015年、公益財団法人かずさDNA研究所から独立して生まれたかずさゲノムテクノロジーズ。同研究所が有する遺伝子資源に提携するPromega社の先端テクノロジーを融合することで、関連技術受託サービス等幅広いニーズに寄り添ったサービスを提供しています。
次世代シーケンス解析については基本的にPromega社を通じてのサービス提供となりますが、同様に1サンプルと小規模から解析を請け負っているのが特徴。ライブラリー調製のみ、ライブラリのクオリティチェックのみなども依頼可能で、柔軟な姿勢で様々なお悩みに応えている会社です。
かずさゲノムテクノロジーズではヒト遺伝子機能研究や遺伝子発現制御研究に使用されるクローンなど、遺伝子資源の販売も行っています。公式サイトでは製品の検索やセット購入に役立つクローンデータベースも公開されており、培われたノウハウや安定した技術力が窺えます。
かずさゲノムテクノロジーズの次世代シーケンス解析は、基本的にはPromega社を通して提供されます。そのため、気になる場合はPromega社の公式HPから問い合わせるのが良いでしょう。サービス内容も同様となっているため、以下をご参照ください。
依頼内容ごとに取得データの目安を設定。基本プランはライブラリ調製+シーケンサーランとなっており、オプションで品質確認も受けることができます。
100万リード~3000万リードと目的に応じて幅広い取得データに対応しており、サービス内容はクオリティチェック+ライブラリ調製+シーケンサーランが基本。価格にはRNA品質検査費用が含まれますが、同社推奨基準を満たせない場合は解析中止やサンプルの再提出などが求められることもあります。
ライブラリ調製+シーケンサーランが基本プランとして、品質確認はオプション。3000万リード程度の解析を基準に、それぞれの依頼内容に応じて取得データ量を設定できるChIP-Seqにも対応しています。
その他、DNAやRNAのロングリード解析や、レーン貸切によるシーケンサーラン、ライブラリのクオリティチェック、抗体可変領域解析なども相談可能です。
このメディアでは、研究要件に合わせて次世代シーケンス受託解析する会社を紹介しています。研究内容に合った解析サービスをお探しの方は、ぜひ参考にしてください。
次世代シーケンス解析は、基本的にはPromega社を通して提供。そのため、シーケンサーについてはPromega社のものとなります。
まず、イルミナ社が提供するNextSeq 500、および NextSeq2000、MiSeq。これはそれぞれに適した用途が異なり、NextSeq 500は主にエクソーム解析や全ゲノム解析、RNA-Seqに用いられる機器です。NextSeq2000は高度な試薬ケミストリーにより、低コストで高品質なデータが得られるのが特徴。MiSeqはコンパクトな卓上型の機器ですが、ロングリード情報が必要な解析に使用されます。
PacBio Sequel IIは1分子リアルタイム(SMRT®)シークエンシングテクノロジーを基盤として、非常に長く高精度なロングリードの取得を実現。DNBSEQ-G400RSはMGI社が提供するシーケンサーで、中規模以上のゲノム解析向けのコアプラットフォームとなっています。
※Promega社を通じ、上記の流れで次世代シーケンス解析を提供しています。
会社名 | 株式会社かずさゲノムテクノロジーズ |
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所在地 | 千葉県木更津市かずさ鎌足2-6-7 |
営業時間 | 公式HP記載なし |
営業日 | 公式HP記載なし |
電話番号 | 0438-52-3900 |
公式サイトURL | https://kazusagt.com/ |
「実験相談窓口」を設け、様々な生物種や解析目的に応じた実験計画から実験プロトコル、データ解析まで研究者の立場に立った提案をしてくれる。
遺伝子解析の中でも、ThruPLEX技術を用いたタカラバイオオリジナル解析サービス「cfDNA変異解析」を提供。変異した遺伝子を検出。
遺伝子バイオマーカーの測定から、コンパニオン診断薬(CDx)を含む体外診断用医薬品の開発、薬事申請、製造販売までワンストップで対応。
【選定条件】
※2023年2月20日調査時点で「次世代シーケンス解析 受託」とGoogle検索し、50位までに表示されるNGS受託サービスを提供する企業29社のうち、「ISO9001」を取得し、他社の受託解析を代理店販売しておらず、公式HPでサービス内容をしっかり確認できる日本資本の会社を3社ピックアップ。その中から公式サイトで確認できる情報をもとに以下の条件で要件ごとに各サービスを選定。
初めての受託解析…北海道システム・サイエンス(調査した結果、3社のうち唯一、実験相談窓口※サービスを行っている)
※参照元:北海道システム・サイエンス公式HP(https://hssnet.co.jp/product/total-support/)
cfDNA変異解析…タカラバイオ(調査した結果、3社のうち唯一、オリジナルcfDNA変異解析※を提供している)
※参照元:タカラバイオ公式HP(https://catalog.takara-bio.co.jp/jutaku/basic_info.php?unitid=U100009437)
新薬の開発…理研ジェネシス(調査した結果、3社のうち唯一、開発・薬事申請・製造販売までワンストップで対応※できる)
※参照元:理研ジェネシス公式HP(https://www.rikengenesis.jp/placement/development.html)