次世代シーケンス解析(NGS)を依頼するなら、どのようなシーケンサーを完備し、どんな解析をしてくれるのか、サービス内容をしっかり確認しておきたいものです。ここでは、次世代シーケンス受託解析をサービス提供するPromegaについて詳しくご紹介します。どの会社へ依頼しようか迷われている方は、ぜひ参考にしてください。
1995年に日本で設立されたPromegaは、生化学関連試薬の製造、および販売に関する事業をメインに担っている企業。自社開発の製品だけでなく受託サービスも幅広く取り扱っており、エピジェネティクスもふまえた次世代シーケンス解析も積極的に提供しています。
Promegaの次世代シーケンス解析は、解析用途に合わせて1サンプルから依頼可能。ライブラリー作製のみ、調製のみなどのプランも揃っており、目的やニーズに寄り添った細やかなサービスを提供していることが窺えます。
Promegaの特徴的な部分として、研究者における“あったらいいな”を追求する場として「プロメガクラブ」を運営していることも挙げられます。会員になれば研究支援や各種イベント、特別価格などのサービスを無料で受けられるので、依頼を検討している方はぜひ確認してみてはいかがでしょうか。
Promegaの次世代シーケンス解析受託サービスは、ロングリードの情報を必要とするものやゲノム解析、エピジェネティクス関連など幅広いメニューが揃っています。ライブラリ調製のみ等細かいサポートにも対応しているため、限られた部分だけ任せたい方にとっても頼もしい会社です。
全ゲノムシークエンスについては、依頼内容ごとに取得データの目安を設定。ライブラリ調製+シーケンサーランが基本プランとなっており、オプションで品質確認も受けることができます。
クオリティチェック+ライブラリ調製+シーケンサーランを基本として、100万リード~3000万リードと目的に応じて幅広い取得データに対応。価格にはRNA品質検査費用が含まれているため良心的ですが、同社推奨基準を満たせない場合はサンプルの再提出や解析中止などが求められることもあります。
こちらも全ゲノムシークエンス同様、ライブラリ調製+シーケンサーランが基本プランで、品質確認はオプション。3000万リード程度の解析を基準として、依頼内容ごとに取得データ量を設定できるChIP-Seqにも対応しています。
その他、DNAやRNAのロングリード解析や、レーン貸切によるシーケンサーラン、ライブラリのクオリティチェックなどにも対応。
このメディアでは、研究要件に合わせて次世代シーケンス受託解析する会社を紹介しています。研究内容に合った解析サービスをお探しの方は、ぜひ参考にしてください。
まず、イルミナ社が開発したシーケンサーであるNextSeqシリーズ、およびMiSeq。NextSeqシリーズは高い出力を誇るのが特徴で、 500は全ゲノムシーケンスに対応。2000は革新的なパターン化フローセル技術を採用することで、多彩なアプリケーションを実現しています。MiSeqは長いリードを必要とする解析に向いており、卓上NGSシーケンサーということでコンパクトな造りです。
PacBio Sequel IIは、1分子リアルタイム(SMRT®)シークエンシングテクノロジーを基盤として、非常に長いリードを得られるのが強み。DNBSEQ-G400RSはハイスループットシーケンサーとして、大規模ゲノム解析向けに造られたコアプラットフォームです。
会社名 | プロメガ株式会社 |
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所在地 | 東京都中央区日本橋小伝馬町1-5 PMO日本橋江戸通7F |
営業時間 | 公式HP記載なし |
営業日 | 公式HP記載なし |
電話番号 | 03-3669-7981 |
公式サイトURL | https://www.promega.co.jp/ |
「実験相談窓口」を設け、様々な生物種や解析目的に応じた実験計画から実験プロトコル、データ解析まで研究者の立場に立った提案をしてくれる。
遺伝子解析の中でも、ThruPLEX技術を用いたタカラバイオオリジナル解析サービス「cfDNA変異解析」を提供。変異した遺伝子を検出。
遺伝子バイオマーカーの測定から、コンパニオン診断薬(CDx)を含む体外診断用医薬品の開発、薬事申請、製造販売までワンストップで対応。
【選定条件】
※2023年2月20日調査時点で「次世代シーケンス解析 受託」とGoogle検索し、50位までに表示されるNGS受託サービスを提供する企業29社のうち、「ISO9001」を取得し、他社の受託解析を代理店販売しておらず、公式HPでサービス内容をしっかり確認できる日本資本の会社を3社ピックアップ。その中から公式サイトで確認できる情報をもとに以下の条件で要件ごとに各サービスを選定。
初めての受託解析…北海道システム・サイエンス(調査した結果、3社のうち唯一、実験相談窓口※サービスを行っている)
※参照元:北海道システム・サイエンス公式HP(https://hssnet.co.jp/product/total-support/)
cfDNA変異解析…タカラバイオ(調査した結果、3社のうち唯一、オリジナルcfDNA変異解析※を提供している)
※参照元:タカラバイオ公式HP(https://catalog.takara-bio.co.jp/jutaku/basic_info.php?unitid=U100009437)
新薬の開発…理研ジェネシス(調査した結果、3社のうち唯一、開発・薬事申請・製造販売までワンストップで対応※できる)
※参照元:理研ジェネシス公式HP(https://www.rikengenesis.jp/placement/development.html)