DNAチップ研究所

引用元：DNAチップ研究所公式HP（https://www.dna-chip.co.jp/）

次世代シーケンス解析（NGS）を依頼するなら、どのようなシーケンサーを完備し、どんな解析をしてくれるのか、サービス内容をしっかり確認しておきたいものです。ここでは、次世代シーケンス受託解析をサービス提供するDNAチップ研究所について詳しくご紹介します。どの会社へ依頼しようか迷われている方は、ぜひ参考にしてください。

DNAチップ研究所はどんな企業なのか

対応するサービスとは

DNAチップ研究所の次世代シーケンス解析は、RNA-SeqやmiRNA-Seq、Small RNA-Seq、エクソーム解析、がん遺伝子パネル解析など多岐にわたります。衛生検査所の資格を有している※ため、ヒト臨床検体の取り扱いも可能です。

RNA-Seq（トランスクリプトーム解析）

mRNAやlincRNAの配列を網羅的にシーケンスすることで、センス、アンチセンス鎖を区別しながら遺伝子発現解析を実施。微量のサンプルやFFPE由来の分解したサンプルなど、幅広いサンプルに対応可能です。

miRNA-Seq/Small RNA-Seq

遺伝子の発現に大きな影響を与えるとされるスプライシングやmiRNAに関わる分子を網羅的に解析するもの。微量サンプルの解析にも力を入れています。

がん遺伝子パネル解析

主にがん遺伝子の遺伝子変異を解析するもので、エクソン領域やホットスポット領域において高い感度の検出に対応。目的に応じた2種類のターゲットリシーケンスが用意されています。

エクソーム解析

同社では、独自に取得した高齢健常コントロール8検体をエクソームデータに混ぜて解析を実施。日本人ならではの変異やシーケリングエラーなどの研究に適しています。

DNAメチル化解析

メチル化パネル解析、およびターゲットBAS解析という2種類の解析法を用意。ターゲットBAS解析の場合はバイサルファイトに変換したのち、指定のPCRプライマーにてターゲット領域の増幅を行います。

16S rRNA解析（細菌叢解析）

ヒトの腸内、皮膚、唾液等のサンプルにどういった細菌がどれだけ含まれるのかを解析します。

その他、全ゲノム解析やレパトア解析、シングルセルRNA-Seq、WGBS、MBD-Seq、ChIP-seq、アンプリコンシーケンスなども受託を請け負っているそうです。

このメディアでは、研究要件に合わせて次世代シーケンス受託解析する会社を紹介しています。研究内容に合った解析サービスをお探しの方は、ぜひ参考にしてください。

シーケンサーの種類

NextSeq500／MiSeq／NovaSeq 6000／HiSeq X

上記はいずれもイルミナ社のシーケンサーで、NextSeq500はエクソーム解析や全ゲノム解析、RNA-Seqに適しているのが特徴。NovaSeq 6000はすべてのゲノムやプロジェクト規模、シーケンス方法に対応でき、HiSeq Xは全ゲノム解析専用、MiSeqはロングリードの情報を必要とする場合によく使われる小型卓上型のシーケンサーです。

PacBio社のPacBio Sequel Ⅱ

こちらはPacBio社のシーケンサーで、1分子リアルタイム（SMRT®）シークエンシングテクノロジーを基盤としていることから、非常に長いリードを高精度で得られるのが特徴です。

受託解析サービスの流れ

1. サンプルのクオリティチェック
2. シーケンスライブラリー調製
3. シーケンス
4. データ解析

※その他、サンプル送付や納品などの詳しい流れについてはDNAチップ研究所へお問い合わせください。

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